October 22, 2024

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Les sciences de la vie « passent par des changements rapides » – ouvrant une opportunité logicielle

Les sciences de la vie « passent par des changements rapides » – ouvrant une opportunité logicielle

Evan Floden nous parle du risque de démarrer Seqera Labs, des opportunités de séquençage et du défi de devenir un PDG.

Evan Floden est le PDG et co-fondateur de Seqera Labs, l’entreprise basée à Barcelone qui fournit des logiciels d’orchestration de données et de flux de travail pour le secteur des sciences de la vie. Ce levé 22 M€ plus tôt cette année et a également obtenu plusieurs subventions de la Chan Zuckerberg Initiative (CZI).

“Un PDG d’une entreprise technologique doit porter plusieurs chapeaux – de la définition de la stratégie et de l’orientation à la représentation publique de l’entreprise en passant par la garantie que nous nous conduisons conformément à nos valeurs”, a déclaré Floden à SiliconRepublic.com.

« Mon rôle principal est de responsabiliser notre équipe. Plus je peux soutenir notre équipe, mieux elle peut soutenir notre mission principale : créer des logiciels indispensables aux efforts de recherche de nos clients.

“Comme beaucoup de start-up, nous avons vu un problème qui devait être résolu”
– EVAN FLODEN

Quels sont les plus grands défis auxquels votre secteur est confronté et comment les relevez-vous ?

Notre secteur est en pleine mutation. Nous assistons à des augmentations massives de l’échelle des données qui doivent être analysées. De nouvelles méthodes de séquençage et d’imagerie évoluent presque quotidiennement. La récente pandémie n’a fait qu’accélérer ces tendances. Les entreprises ont dû faire évoluer considérablement leurs capacités de calcul et d’analyse.

Ces tendances sont bien comprises dans notre industrie. Une partie de notre approche a consisté à les devancer en anticipant les problèmes de second et troisième ordre et en les résolvant. Par exemple, ce n’était un secret pour personne que les clients souhaitaient transférer leurs charges de travail vers le cloud. Cependant, nous avons réalisé qu’ils auraient également besoin de fonctionnalités de portabilité, de provisionnement automatisé et d’optimisation.

La reproductibilité est également essentielle dans notre industrie. Nous pourrions anticiper des besoins tels que le contrôle de version pour les pipelines et les ensembles de données et de meilleures façons de gérer les conteneurs à grande échelle. La résolution de ces problèmes et d’autres a guidé notre programme de développement.

Quelles sont les principales opportunités sectorielles sur lesquelles vous capitalisez ?

Je pense qu’il y a plusieurs opportunités dans notre espace. Plus que de nombreuses autres industries, les entreprises de biotechnologie ont massivement adopté le cloud computing. Nous nous sommes efforcés de rendre l’expérience d’exploitation des services de calcul et de stockage dans le cloud transparente, en offrant des intégrations avec toutes les principales technologies de cloud et de stockage dans le cloud.

Une autre opportunité est l’idée de ‘seq-everything’. Il n’y a pas si longtemps, le séquençage d’un génome coûtait horriblement cher. Vous avez entendu l’histoire – séquençage du premier génome humain a pris 13 ans et coûté des milliards de dollars. Aujourd’hui, les coûts ont chuté à bien moins de 500 $.

Les obstacles au séquençage sont rapidement tombés et Seqera Labs est à l’avant-garde de la résolution du prochain goulot d’étranglement, ce qui permet d’analyser rapidement et à moindre coût toutes ces séquences. La combinaison d’un séquençage et d’une analyse rapides et peu coûteux est passionnante. Ils conduiront à plus de dépistage génétique, à de meilleurs soins préventifs et à des médicaments génétiquement ciblés plus efficaces.

Qu’est-ce qui vous a mis sur la voie où vous êtes maintenant ?

Comme beaucoup de start-up, nous avons vu un problème qui devait être résolu. Mon associé et co-fondateur, Paolo Di Tommaso, a travaillé sur des outils d’analyse au Centre de régulation génomique de Barcelone. Son travail consistait à aider à rendre les équipes de recherche plus efficaces, et il était évident que les outils de l’époque posaient de nombreux problèmes.

Il a créé Nextflow open source, et l’adoption a été phénoménale. Il s’avère que beaucoup de gens ont eu ces mêmes problèmes. Aujourd’hui, Nextflow est une communauté open source dynamique avec des milliers d’utilisateurs actifs, téléchargés plus de 55 000 fois par mois.

Nous avons réalisé que les organisations avaient d’autres besoins non satisfaits liés à l’automatisation, à la collaboration sécurisée et à l’automatisation de l’infrastructure cloud. Nous avons également constaté la nécessité de rendre les pipelines complexes plus accessibles aux non-spécialistes de l’informatique. Nous devions voir plus grand si nous voulions nous attaquer à cette prochaine série de problèmes, et nous avons décidé de lancer Seqera Labs en 2019.

Quel est le plus gros risque que vous ayez jamais pris ?

Je suppose qu’il faudrait fonder Seqera Labs et décider de se lancer à plein temps, sans revenus et avec un minimum d’argent. Nous avons eu la chance d’avoir pu attirer un financement de démarrage précoce. Heureusement, nous avions également une communauté de personnes talentueuses qui travaillaient sur Nextflow depuis des années. Ils partageaient notre vision et comprenaient précisément les problèmes que nous essayions de résoudre.

Du côté de la communauté ouverte, nous sommes reconnaissants au CZI d’avoir accordé des subventions dans le cadre de son programme Essential Open Software for Sciences. Ils ont reconnu la valeur de Nextflow et d’une communauté parallèle appelée Nf-core avec plus de 1 000 contributeurs.

Quelle compétence de travail aimeriez-vous avoir ?

J’ai dû grandir dans mon rôle, et je sais que les leaders peuvent être aveugles à leurs faiblesses. J’ai la chance d’avoir une équipe solide autour de moi qui n’a pas peur de me dire quand ils pensent que j’ai tort.

J’ai été conscient de la nécessité de changer mon état d’esprit de celui d’un contributeur individuel à un PDG. Je trouve la technologie fascinante. Laissé à moi-même, je remplirais probablement ma journée de réunions avec les clients – présentant la technologie et découvrant les problèmes intéressants que les clients essaient de résoudre.

Cependant, mon problème d’attribution de temps commence à se résoudre de lui-même. Au fur et à mesure que Seqera Labs s’est développé, j’ai beaucoup plus de demandes sur mon temps et j’ai été obligé de déléguer. Au fur et à mesure que nous avons constitué notre équipe de direction, j’ai consciemment recherché des personnes ayant des compétences et des expériences différentes des miennes. Espérons que cela aidera à atténuer certains de ces angles morts potentiels.

Comment tirez-vous le meilleur parti de votre équipe?

Notre équipe de direction a une philosophie similaire. Nous recherchons l’excellence, mais essayons également de donner aux gens l’espace dont ils ont besoin pour grandir et essayer des choses. Nous avons eu la chance d’attirer des talents au sommet de leurs disciplines respectives. Ces personnes sont déjà motivées. Je crois que ce qui fonctionne, c’est de décrire le résultat souhaité et de faire confiance à leur jugement sur la façon d’y parvenir.

Je pense qu’il est également important de garder une organisation plate et d’être transparent. Nous essayons de reconnaître le succès et de favoriser une culture qui encourage l’esprit d’équipe et la collaboration. Les valeurs sont importantes. Bien que nous nous soyons concentrés tête baissée sur la croissance et l’amélioration de la plateforme, nous avons également passé du temps à réfléchir au type d’organisation que nous voulons être.

Nous ne perdons pas de vue que le maintien d’une excellente culture devient plus difficile à mesure qu’une entreprise évolue. À cet égard, l’évolutivité dépend de la constitution d’une équipe de direction qui « prêche par l’exemple » et donne l’exemple.

Avez-vous constaté un problème de diversité dans votre secteur ?

Absolument. La bioinformatique se situe carrément à l’intersection de l’informatique à haute performance et de la biologie, deux domaines dominés par les hommes dans les rôles supérieurs.

Nous pouvons gérer la diversité sur notre lieu de travail, mais du côté open source/communautaire, c’est un autre domaine où le CZI a joué un rôle déterminant. Nous animons une communauté annuelle État du flux de travail enquête. Cette année, nous avons commencé à collecter des informations démographiques pour réaliser certaines mesures de base. Nous faisons mieux que l’ensemble de la communauté informatique haute performance en termes de diversité, mais pas beaucoup.

Le financement de CZI nous a permis de mener des programmes actifs de sensibilisation et de mentorat auprès de groupes sous-représentés et de régions géographiques. En septembre, nous publié un article détaillant les résultats des premiers cycles de mentorat Nextflow et Nf-core. Notre deuxième cycle de mentorat a commencé en octobre, et nous espérons démontrer que nous avons déplacé l’aiguille de l’inclusivité dans les futures enquêtes communautaires.

Quels livres avez-vous lu que vous recommanderiez?

Quand je ne joue pas à Fortnite, j’aime lire des non-fictions, en particulier liées à la science. L’Empereur de toutes les maladies de Siddhartha Mukherjee est l’un des meilleurs exemples de tissage de narration épique avec une expertise approfondie du domaine que j’ai rencontré.

Je suppose que cela me plaît parce que le sujet est dans notre timonerie. Le livre traite des défis en oncologie et, bien sûr, l’empereur de toutes les maladies est le cancer. Le livre suit notre compréhension du cancer sur des milliers d’années. Ce qui rend cela exaltant, c’est que notre génération pourrait enfin être celle qui le comprendra et le vaincra.

Quels sont les outils et ressources essentiels qui vous permettent de passer la semaine de travail ?

Comme la plupart des start-ups, nous utilisons de nombreux outils internes – de Notion à Slack en passant par HubSpot et Zoom.

Mon vélo est aussi un outil essentiel pour passer la semaine. Cela m’aide non seulement à me rendre au bureau à Barcelone, mais cela me donne également l’occasion de me détendre et de me vider la tête lors de longs trajets le week-end. Cela m’aide toujours à prendre du recul et, espérons-le, fait de moi un leader plus complet.

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